המרדף המטורלל של הסנאי סקראט אחר הבלוט המקולל, אחריו הוא רודף כבר מאחרית הימים, גורם להשלכות המשנות את העולם. אסון עולמי השולח את מאני, דייגו וסיד להרפתקה הגדולה ביותר שלהם עד כה. בעקבות השינויים הגדולים, סיד מתאחד עם הסבתא המבולבלת שלו, והעדר נתקל בחבורת שודדי ים אכזריים הנחושים למנוע מהם לחזור הביתה.